Вернуться в библиотеку

Развитие моделей программирования в Grid

О.В. Сухорослов
ИПМ им. М.В.Келдыша РАН
Москва 2005.


http://agora.guru.ru/abrau2008/pdf/094.pdf

Базовой моделью использования современной Grid-инфраструктуры является запуск заданий в пакетном режиме, во многом повторяющий способ взаимодействия пользователя с вычислительным кластером. Главным образом, эта модель используется для запуска большого числа однотипных, независимых заданий. Однако не всегда задача пользователя укладывается в подобную схему. Для реализации новых Grid-приложений требуются высокоуровневые средства и модели программирования в Grid. В первую очередь, речь идет именно о средствах и инструментариях, упрощающих программирование и скрывающих от пользователя динамические аспекты распределенной среды. Данная работа посвящена не только тому, что уже сделано в этом направлении, но и намечает дальнейшие пути развития моделей программирования в Grid.

Первым шагом в указанном выше направлении стала поддержка запуска параллельных программ на отдельных кластерах Grid. С одной стороны, подобная возможность дает пользователю максимальную свободу в реализации схемы взаимодействия параллельных процессов. С другой стороны, доступные такому заданию вычислительные ресурсы ограничены ресурсами только одного кластера, причем с учетом его загрузки заданиями других пользователей. Для преодоления указанного ограничения были созданы распределенные реализации MPI(MPICH-G2, PACX-MPI, GridMPI), позволяющие запускать MPI-программы “поверх” нескольких кластеров. Данный подход имеет ряд проблем, обусловленных особенностями среды Grid. Глобальный характер Gridприводит к высоким накладным расходам при обмене данными между процессами на различных кластерах, что требует соответствующей модификации алгоритма и программы. Децентрализованная структура Gridзатрудняет развертывание подобных реализаций MPIи синхронный запуск заданий на нескольких кластерах. Существенным недостатком подобных реализаций является отсутствие механизма восстановления после отказов, вызванных, например, преждевременным завершением задания на одном из кластеров.

Модель “мастер-рабочие” применяется в тех случаях, когда необходимо организовать динамическую балансировку нагрузки между группой рабочих процессов, обрабатывающих отдельные подзадачи. Данная необходимость может быть обусловлена неравномерностью и динамичностью как подзадач, так и доступных вычислительных узлов. Заметим, что последнее обстоятельство ярко выражено в Grid. Казалось бы, можно запускать подзадачи в виде заданий и полагаться на балансировку нагрузки, осуществляемую сервисом управления заданиями Grid. Однако проведенные вычислительные эксперименты показали, что такой подход менее эффективен, чем собственная реализация модели “мастер-рабочие” с запуском в Gridне самих подзадач, а рабочих. Вызвано это, главным образом, значительными накладными расходами по запуску заданий в Grid. Гораздо быстрее передать новую подзадачу уже запущенному в Gridзаданию напрямую по сети, минуя промежуточное ПО Grid. Кроме того, сервис управления заданиями Gridосуществляет планирование выполнения каждого задания независимо от других заданий и не позволяет использовать собственную стратегию планирования.

Для упрощения разработки Grid-приложений, использующих модель “мастер-рабочие”, требуется соответствующий программный инструментарий. Данный инструментарий должен содержать “заготовки” для мастера и рабочих, реализовывать динамический запуск рабочих в Gridи обеспечивать восстановление после отказов. Прототипом подобного инструментария может служить пакет CondorMW[1], реализующий модель “мастер-рабочие” в системе Condorи поддерживающий разработку приложений на языке C++. Автором статьи разработан прототип инструментария gMW, предназначенного для реализации “master-worker” приложений на языке Javaповерх Grid-инфраструктуры EGEE. Инструментарий gMWпозволяет запустить в Gridнеобходимое число рабочих процессов и использовать их через стандартный интерфейс платформы JavaExecutorService. В ходе вычислений gMWконтролирует статус рабочих процессов и автоматически осуществляет их перезапуск. Для автоматической балансировки нагрузки между рабочими процессами используется pull-схема, когда свободные рабочие сами извлекают задания из очереди мастера.

Workflow-модель применяется в случае, если требуется связать в единый процесс несколько заданий [2]. Зависимости между заданиями часто описываются в виде ориентированного графа, ребра которого определяют порядок выполнения заданий и потоки данных между заданиями. Workflow-система осуществляет запуск отдельных заданий, передачу данных между ними и контроль за выполнением процесса в соответствии с его описанием. В качестве примера такой системы можно привести входящий в состав пакета Condorкомпонент DAGMan. Потребность в подобной модели программирования в Gridвелика, поскольку сложные процессы анализа и обработки данных могут состоять из сотен элементарных заданий, ручной запуск и координация которых практически невозможны.

Инфраструктура EGEEподдерживает запуск workflow-заданий, описываемых в виде ориентированного ациклического графа (ОАГ), вершинами которого являются простые Grid-задания. Выполнение таких заданий реализуется с помощью вышеупомянутого компонента DAGMan. Обмен данными между заданиями происходит через входные и выходные файлы заданий. Возможностей подобной модели во многих случаях достаточно. Тем не менее, можно выделить несколько направлений ее совершенствования.

Во-первых, не всегда выразительных возможностей ОАГ достаточно для описания желаемой структуры процесса. Затруднения возникают, например, при описании циклов и условных переходов. Наиболее часто предлагаемые решения: введение в ОАГ специальных вершин [3], применение формализма сетей Петри [4] или создание языков описания процессов [5]. Во-вторых, спектр механизмов взаимодействия между заданиями не должен ограничиваться файлами, причем доступными только после завершения задания. В зависимости от характера и относительного размещения заданий в Gridэто может быть общая память, распределенная файловая система или TCP-канал. Подобные механизмы особенно эффективны в случае, если задания могут быть запущены одновременно в режиме “producer-consumer”. Примером реализации этой модели в распределенной среде может служить система Dryad[6]. Наконец, требуется реализовать динамическую коррекцию структуры процесса в зависимости от входных данных и количества доступных ресурсов. Это позволило бы не описывать в отдельности каждую из сотен однотипных задач, а ограничиться только описанием отдельных стадий процесса. Примером для подражания здесь также может служить система Dryad.

Grid-сервисы создаются для того, чтобы предоставить пользователям Gridдоступ к некоторому ресурсу, будь то вычислительный пакет, база данных или экспериментальная установка. Речь идет о проблемно-ориентированных сервисах, расширяющих возможности и формирующих новое поколение Grid-систем [7]. Примером реализации подобного подхода может служить инструментарий IARnet[8], предназначенный для интеграции распределенных алгоритмических ресурсов при решении прикладных задач. Для работы Grid-сервисов необходима инфраструктура, обеспечивающая бесперебойный доступ к сервисам, хранение данных и требуемые для обработки запросов вычислительные мощности. В этом отношении Grid-инфраструктура может сыграть роль платформы для таких сервисов. Рассмотрим этот вопрос подробнее.

Не каждый разработчик имеет возможность разместить Grid-сервис на соответствующем сервере. Запускать сервис в Gridв виде задания не имеет смысла. Во-первых, время выполнения задания ограничено. Во-вторых, из соображений безопасности на рабочих узлах обычно запрещены входящие соединения, что не позволяет размещать на них серверные приложения. Таким образом, требуется дополнительная инфраструктура для хостинга Grid- сервисов. Примером для подражания здесь может служить сервис EC2 компании Amazon.

Более реалистичной сейчас является схема, когда Grid-сервис размещается на сервере разработчика, но для вычислений и хранения данных он использует Grid. В качестве примера реализации такой схемы можно привести разрабатываемый в рамках проекта “Электронная Земля” сервис обработки геоданных. Сервис GDPS предоставляет доступ к вычислительно сложным алгоритмам в области наук о Земле и поддерживает запуск соответствующих вычислений в Grid. Взаимодействие пользователя с сервисом осуществляется через Web-портал проекта. Пользователь формирует через интерфейс портала набор входных данных, выбирает из списка алгоритмов, представляемых сервисом, интересующий его алгоритм обработки данных, и указывает необходимые параметры алгоритма. Портал отправляет сформированное пользователем задание сервису GDPS. Сервис производит загрузку данных, находит требуемый алгоритм и осуществляет запуск задания в Grid. Пользователь может отслеживать статус своего задания через портал. После окончания выполнения задания, результаты задания загружаются из Grid, передаются на портал и отображаются пользователю. Отметим, что описанная схема работы пользователя с Gridне требует специальной подготовки и позволяет сконцентрироваться на решаемой задаче.